1999， 迎着世纪交替的曙光， 在国家网络安全和信息化核心技术 “缺芯少魂”的困局下， 根据国家战略， 中国科学院软件所 与赛迪强强联合成立了中科红旗， 红旗完成了第一个版本的开发， 让中国真正拥有了自己的国产操作系统， 红旗迎来了1.0时代， 也让中国基础软件开始占据 最核心的阵地。 青春，闪亮， 那是我们最初的模样。

光辉历程，不忘初心； 血与火的斗争，熔铸建军之本； 生与死的考验，磨砺强军之魂。 战争年代虽已远去，但在和平岁月中 依然少不了这群被称为“最可爱的人”的身影。

该版本基于openEuler 20.03-LTS-SP1进行开发，与Server版本的最大区别是植入了原生GNOME 3.30做为桌面环境，为普通用户和开发人员提供了新的工具和功能。GNOME 3.30增加了收藏文件、文件夹和联系人的功能，以便于更轻松的编组和访问这些内容。

2021年7月9日，中科红旗（北京）信息科技有限公司再次入选中国电子工业标准化技术协会信息技术服务分会（简称：ITSS）会员单位及国家信息技术服务标准工作组观察成员单位。

红旗Linux桌面操作系统v11及后续迭代版本永久向个人及家庭用户免费提供，并将通过红旗操作系统社区（linuxsir.cn）提供相应的免费系统资源与技术支持服务。

为贯彻落实国家建设信息安全保障体系的要求，充分发挥中科红旗与福昕鲲鹏在自主可控技术研究与产品开发、创新技术行业应用等领域的优势，积极探索有效的技术及产业合作途径，推动技术创新体系和知识创新体系的有机融合，中科红旗（北京）信息科技有限公司与福昕鲲鹏（北京）信息科技有限公司于2021年5月31日在北京签订战略合作协议。

2021年5月21日,由中科红旗（北京）信息科技有限公司研发的红旗浏览器V1.0.0.1正式发布并开放下载。

随着“云+AI+5G”时代的高速到来，促使整个社会加速从物与物的连接、人与人的联接转化到万物互联，在这一过程中，不仅需要面对随之而来的海量数据和各式全新业务形态，更要满足对多元算力、多元场景以及网络和数据安全等全方面的综合考量与要求。

北京时间 2021 年 4 月 30 日，由中科红旗（北京）信息科技有限公司研发的红旗Linux桌面操作系统V11 ARM版本 (AArch64) 开放下载。此次发布的红旗Linux11 ARM版本定位于面向红旗Linux生态伙伴、开发者和Linux爱好者的体验版本，这是中科红旗推出的基于Debian的ARM发行版。

由中科红旗（北京）信息科技有限公司研发的红旗Asianux服务器操作系统(欧拉版)V8.1发布更新日志(0430)。红旗Asianux服务器操作系统(欧拉版)V8.1定位于面向小微企业、开发者和Linux爱好者的高性能服务器操作系统。